2014 / 8 / 3 課前提問回覆 軟體篇

 

作者:陳一銘 / 蔡依橙

 

 

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問:想進行診所臨床資料分析、資料庫建立、線上資料庫(國健局國興系統)整理問題。未寫過 review article 及 meta-analysis,該如何進行?統計軟體僅用過初級 SPSS,投稿圖檔為 word 轉 graphpad,或用 illustrator/photoshop 軟體,想知道有無更便捷的方法。想熟悉 endnote or reference management 在 reference 整理用法。Sigmaplot or NCSS pass 軟體的優點為何?

 

答:(蔡依橙)資料庫研究,如果是自己的患者,其實用 excel 就能整理得很好了。我自己經 IRB 通過,收入研究的心臟影像患者,超過 3000 位,全部在醫院電腦內,用 excel 輸入基本資料、掃描參數、重要發現,影像則用 PACS 轉存 JPG,並使用診斷名稱建立資料夾,之後用 Windows 內建的搜尋功能,要撈 prosthetic valveAmplatzer septal occluderpulmonary hypertension,都瞬間有結果。

 

Meta-analysis 屬於 dry lab 領域,起步需要的技能不同,超越本次課程範圍,國際上有許多 workshop 可上,或可找台灣各大醫院的 dry lab 高人合作。

 

Review article 較為簡單,不需 IRB,但要被接受,需要您對該領域的紮實理解,即使提出不同的看法,也能引經據典的提出論述。例如我在 2008 年發表的 Neonatal cardiac multidetector row CT: why and how we do it,是根據之前三篇,我們在這個領域的重要研究,延續而來的。

 

製圖部分,其實 SPSS 與 Excel 就足夠了,這兩個軟體雖然預設的範本有點醜,但因為手動功能多,調整一下大小、顏色、設計,圖表就會非常漂亮。或者,我們上課將會使用的 MedCalc,也相當不錯。

 

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 這張圖,是用 Excel 畫的。

 

EndNote 有許多臨床醫師愛用,不過陳一銘醫師與我使用的經驗都不好,我曾經弄到 Word 死當,最後要重灌電腦才能解決,非常不愉快的經驗。所以我自己的參考資料整理都是手動處理的,其實並沒有想像中的難,而且因為我自己建 Word 表格,處理順序、筆記、引用重點等,都很快速。

 

至於 Sigmaplot 與 NCSS pass,我們兩人均沒有使用經驗,很不好意思。

 

我們的寫作經驗中,其實微軟的 Word、Excel、PowerPoint,加上一個統計軟體如 MedCalc 或 SPSS,就能解決九成五以上的問題了。

 

 

問:如何有系統整理與歸檔 reference?用 EndNote 或 Reference Manager 好?論文寫作的軟體有很多,例如 EndNote、Mendeley 等等。請問在論文寫作時選擇甚麼樣的軟體或是平台能夠事半功倍?

 

答:(蔡依橙)陳一銘醫師與我,其實都是拿 Word 畫表格,來記錄 reference。土法煉鋼聽起來很遜,但實際做起來蠻快的,而且如果流程處理得好,即使 revision 要重排順序,也不會太難。

 

多數人寫文章,reference 都在 30 篇以下,其實用 Word 自己整理就可以了,在一些特殊情況,例如引用 Wikipedia 的 review article,甚至還更方便、更自由。

 

考量到不是每家醫院都有買 EndNote 或 Reference Manager,這樣的做法蠻實際。

 

如果 EndNote 跟 Reference Manager 來比,我比較多朋友用 EndNote,他們也用得很開心。

 

 

問:因為對統計沒有概念,尤其是對一群數字化的 data,想要針對哪兩項變項做分析,不知道用哪種檢定法,希望在「用軟體學統計」這堂課可以有比較清楚的了解及概念。針對論文寫作方式,本身寫 case report 與 reviewer 交手的經驗,常常因為跟 reviewer 的觀點對不到焦,希望可以在本堂課學習到真正的「論文寫作內功心法」。

 

答:(蔡依橙)這次的互動實作時間,就是針對統計作實際上機的訓練,現場除了指定題目外,也歡迎您趁空檔,多詢問兩位講者。

 

這次的課程安排,包括了各種文體的寫作建議、常犯錯誤,而且是從 reviewer 審稿的角度來設計課程,相信對您會有很大的幫助的!

 

 

最新課程,由此去

 

 

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